Mark Aanderud porta més de 18 anys liderant els seus propis projectes, en els quals exerceix alhora de compositor, productor i executant de piano, teclats i mitjans electrònics. Comença amb el Mark Aanderud Trio el 1998, amb el qual recorre els Estats Units i Mèxic, així com diversos països de Sud-amèrica i Europa, on obté el premi al millor músic de l’any i, el 1999, el premi al millor disc de l’any amb Trio ’02, atorgat pels Czech Music Awards. Posteriorment, grava els discos Introducing i Música de Cámara e Improvisaciones, aquest últim amb la participació de l’Ensamble de solistes de l’Orquestra Mexicana de les Arts. El 2010 signa amb la discogràfica anglesa Rarenoise Records per editar el seu projecte Mole, que compta ja amb tres produccions discogràfiques que han rebut les millors crítiques internacionals.
Mark Aanderud ha gravat més de 15 discos propis i en els últims 15 anys ha creat, gravat i girat amb més de 40 projectes col·laborant amb una gran diversitat d’artistes de talla mundial com The Mars Volta, David Gilmore, Tim Berne, Billy Martin (Medeski, Martin, Wood), Cyro Baptista, Omar Rodríguez López, Eric Reeves, Stomu Takeishi, Natalia Lafourcade, Armand Sabal-Lecco, Wolfgang Hafner, Marc Miralta, Magos Herrera, Agustín Bernal, Steven Bernstein (Sex Mob), Bill McHenry, Jonathan Kreizberg, Eli Degibri, Pierre Bertrand, Raynald Colom, Eugenia León, Eugenio Toussaint i molts altres.
A part de la seva tasca com a executant i compositor, Mark Aanderud exerceix també com a docent i ha dut a terme clinics i classes privades, així com masterclasses i cursos a Mèxic, Estats Units, França, Colòmbia, la República Txeca i Espanya. Mark va ser codirector de la càtedra de piano del Conservatori Internacional de Música de Praga. Els projectes més recents de Mark Aanderud són PianoLoops, Animatic Theatre, MASEnsemble, MATRIO, Mole i Grupo Quebrante. Actualment, és professor d’instrument al Taller de Músics ESEM.